Au Monastère des Jésuites d’Athènes ont été rassemblées trois archives historiques de la Compagnie de Jésus en Grèce : celle de Syros (ATIS), celle de Tinos (ATIT) et celle d’Athènes. Progressivement, ces archives se sont enrichies de documents provenant d’autres monastères, tels que ceux de Naxos, de Santorin, etc., ainsi que d’organismes institutionnels ou de personnalités, comme le Monastère des Ursulines, le fondateur du monastère de Syros, Nikolaos Marangos, l’évêque Fonton et l’historien Antonios Sigalas.
Parmi les différentes archives jésuites que conserve aujourd’hui le Monastère d’Athènes, se distingue celle de la Compagnie de Jésus de Syros (ATIS). En effet, au cours de cinq périodes de l’existence du monastère sur l’île, des pères jésuites passionnés d’histoire ont consacré une partie de leur précieux temps à collecter et à consigner des documents : manuscrits, publications, photographies et enregistrements audiovisuels.