Η Μονή Ιησουϊτών ιδρύθηκε το 1670 με έδρα την τότε πόλη του Εξωμβούργου και αποτέλεσε την πρώτη καθολική μονή του νησιού.
Το 1846 το μοναστήρι μεταφέρθηκε στη σημερινή του θέση, στο χωριό Λουτρά.
Στις αρχές του 20ου αιώνα, μόνασαν σε αυτό λίγοι αλλοδαποί μοναχοί, ασχολούμενοι με την κατήχηση και τη διαπαιδαγώγηση των νέων αλλά και με τη γεωργία.
Αργότερα ο ηγούμενος της μονής, Δομένικος Βουτσινός, ανέλαβε σημαντική δράση για την ανέγερση του προσκυνήματος της Ιεράς Καρδίας του Ιησού.
Τη δεκαετία του 1980 ζούσαν στο μοναστήρι περίπου 10 μονάχοι, ενώ σήμερα ο μοναδικός κάτοικος είναι ο υπέυθυνος για το χώρο ιερέας.
Η βιβλιοθήκη της μονής αριθμεί πάνω από 6.000 τίλους βιβλίων και μεταφέρθηκε στην Αθήνα το φθινόπωρο του 2019 και περιέχει βιβλία που χρονολογούνται από τον 16ο αιώνα. Το αρχείο μεταφέρθηκε το 2015 στην Αθήνα με έγγραφα από τον 17ο αιώνα.
Στη μονή λειτουργεί επίσης το Λαογραφικό Μουσείο Λουτρών.
Ο ναός του Αγίου Ιωσήφ που βρίσκεται δίπλα στη μονή αποτέλεσε σημαντικό θρησκευτικό κέντρο την περίοδο της ακμής της μονής.Η Μονή των Πατέρων Ιησουϊτών και ο ναός του Αγίου Ιωσήφ έχουν υποστεί εκτεταμένες φθορές και δεν είναι επισκέψιμοι χώροι, με εξαίρεση το Λαογραφικό Μουσείο.
Η Ιερά Μονή των Ιησουϊτών βρίσκεται στο χωριό Λουτρά.